Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N9

Syt9, Synaptotagmin-9, mousemouse

Predictions only

Length 491 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt9Q9R0N9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.72■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC20.71■□□□□ 0.91
Syt9Q9R0N9 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.7■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC20.69■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.69■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.68■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.9
Syt9Q9R0N9 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Syt9Q9R0N9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Syt9Q9R0N9 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Syt9Q9R0N9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt9Q9R0N9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt9Q9R0N9 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Syt9Q9R0N9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Syt9Q9R0N9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC20.44■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.6 ms