Protein–RNA interactions for Protein: Q9R088

Tk2, Thymidine kinase 2, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tk2Q9R088 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC24.02■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Tk2Q9R088 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.43
Tk2Q9R088 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Tk2Q9R088 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC23.89■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.86■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC23.84■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Tk2Q9R088 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Tk2Q9R088 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tk2Q9R088 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Tk2Q9R088 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tk2Q9R088 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tk2Q9R088 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Tk2Q9R088 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tk2Q9R088 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC23.77■■□□□ 1.4
Tk2Q9R088 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.76■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC23.75■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.74■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC23.73■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Tk2Q9R088 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.1 ms