Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS8

Sh2d3c, SH2 domain-containing protein 3C, mousemouse

Predictions only

Length 854 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sh2d3cQ9QZS8 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Sh2d3cQ9QZS8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Macrod2-205ENSMUST00000110063 845 ntTSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC22.66■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Popdc3-201ENSMUST00000019994 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
Sh2d3cQ9QZS8 Aard-201ENSMUST00000090025 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Sh2d3cQ9QZS8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm7334-201ENSMUST00000061681 1356 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Sh2d3cQ9QZS8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.7 ms