Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYK9

Pnck, Calcium/calmodulin-dependent protein kinase type 1B, mousemouse

Predictions only

Length 343 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PnckQ9QYK9 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
PnckQ9QYK9 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
PnckQ9QYK9 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.26■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
PnckQ9QYK9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PnckQ9QYK9 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Iffo2-203ENSMUST00000174078 5716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.12■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
PnckQ9QYK9 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
PnckQ9QYK9 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.01■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
PnckQ9QYK9 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 547.4 ms