Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXX8

Nufip1, Nuclear fragile X mental retardation-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 484 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nufip1Q9QXX8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Nufip1Q9QXX8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Nufip1Q9QXX8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Nufip1Q9QXX8 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nufip1Q9QXX8 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nufip1Q9QXX8 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Nufip1Q9QXX8 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Nufip1Q9QXX8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Nufip1Q9QXX8 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Nufip1Q9QXX8 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Igfbp3-202ENSMUST00000135887 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Nufip1Q9QXX8 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Nufip1Q9QXX8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nufip1Q9QXX8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nufip1Q9QXX8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
Nufip1Q9QXX8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Nufip1Q9QXX8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nufip1Q9QXX8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Nufip1Q9QXX8 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nufip1Q9QXX8 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Nufip1Q9QXX8 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nufip1Q9QXX8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nufip1Q9QXX8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Nufip1Q9QXX8 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Nufip1Q9QXX8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC23.35■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Nufip1Q9QXX8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Nufip1Q9QXX8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Nufip1Q9QXX8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.7 ms