Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXV0

Pcsk1n, ProSAAS, mousemouse

Predictions only

Length 258 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pcsk1nQ9QXV0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Pcsk1nQ9QXV0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Pcsk1nQ9QXV0 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.41■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Pcsk1nQ9QXV0 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Pcsk1nQ9QXV0 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Pcsk1nQ9QXV0 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Pcsk1nQ9QXV0 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Pcsk1nQ9QXV0 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.3 ms