Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXT8

Kcnip3, Calsenilin, mousemouse

Predictions only

Length 256 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kcnip3Q9QXT8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.74■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Fam220a-203ENSMUST00000118121 919 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
Kcnip3Q9QXT8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.69■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Foxd1-201ENSMUST00000105098 5064 ntAPPRIS P1 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Smad2-202ENSMUST00000091831 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 Crebl2-202ENSMUST00000111937 612 ntTSL 3 BASIC18.65■□□□□ 0.58
Kcnip3Q9QXT8 B3gat3-201ENSMUST00000096243 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Map3k21-201ENSMUST00000034316 5693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Kcnip3Q9QXT8 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Mat2b-201ENSMUST00000040167 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Slc12a2-201ENSMUST00000115366 6520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Phlda1-201ENSMUST00000164773 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ubl4a-207ENSMUST00000178691 1038 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
Kcnip3Q9QXT8 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Kcnip3Q9QXT8 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms