Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXK2

Rad18, E3 ubiquitin-protein ligase RAD18, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 509 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rad18Q9QXK2 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Rad18Q9QXK2 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Rad18Q9QXK2 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Rad18Q9QXK2 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Htra3-201ENSMUST00000087629 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Rad18Q9QXK2 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Rad18Q9QXK2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 200.4 ms