Protein–RNA interactions for Protein: Q9QXG9

Tinf2, TERF1-interacting nuclear factor 2, mousemouse

Predictions only

Length 341 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tinf2Q9QXG9 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Tinf2Q9QXG9 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.91■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Tinf2Q9QXG9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Tinf2Q9QXG9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Tinf2Q9QXG9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.3 ms