Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLY0

Socs6, Suppressor of cytokine signaling 6, mousemouse

Predictions only

Length 533 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Socs6Q9JLY0 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 Phf23-205ENSMUST00000135814 2214 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Socs6Q9JLY0 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Socs6Q9JLY0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Socs6Q9JLY0 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Socs6Q9JLY0 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Socs6Q9JLY0 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Socs6Q9JLY0 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Socs6Q9JLY0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Socs6Q9JLY0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Socs6Q9JLY0 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Socs6Q9JLY0 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
Socs6Q9JLY0 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Socs6Q9JLY0 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Socs6Q9JLY0 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Socs6Q9JLY0 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC23.07■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC23.07■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Cetn4-201ENSMUST00000071400 1808 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Socs6Q9JLY0 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Socs6Q9JLY0 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.95■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Irx4-201ENSMUST00000022095 2589 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC22.92■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Socs6Q9JLY0 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.6 ms