Protein–RNA interactions for Protein: Q9JLF7

Tlr5, Toll-like receptor 5, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tlr5Q9JLF7 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Tlr5Q9JLF7 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC25.58■■□□□ 1.69
Tlr5Q9JLF7 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.58■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Tlr5Q9JLF7 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr5Q9JLF7 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr5Q9JLF7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Tlr5Q9JLF7 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr5Q9JLF7 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Tlr5Q9JLF7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tlr5Q9JLF7 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tlr5Q9JLF7 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Tlr5Q9JLF7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Tlr5Q9JLF7 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Tlr5Q9JLF7 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Tlr5Q9JLF7 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.42■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Tlr5Q9JLF7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC25.38■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.37■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Tlr5Q9JLF7 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 Gm14121-201ENSMUST00000121441 1380 ntBASIC25.28■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.27■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC25.27■■□□□ 1.64
Tlr5Q9JLF7 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Tlr5Q9JLF7 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.26■■□□□ 1.63
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.7 ms