Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKE2

Trem1, Triggering receptor expressed on myeloid cells 1, mousemouse

Predictions only

Length 230 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trem1Q9JKE2 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 Mfsd5-201ENSMUST00000051341 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Trem1Q9JKE2 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Thra-201ENSMUST00000064187 2452 ntTSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC20.92■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Gm8066-201ENSMUST00000197762 485 ntTSL 3 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Grk2-210ENSMUST00000171123 1439 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Trem1Q9JKE2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Eif3j2-201ENSMUST00000057110 2379 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Akt1s1-202ENSMUST00000107880 1757 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC20.88■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.88■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Lmo2-201ENSMUST00000111139 1434 ntTSL 5 BASIC20.87■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.86■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC20.85■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Kcnk1-201ENSMUST00000046765 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC20.85■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Osbpl2-201ENSMUST00000040668 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Paip1-203ENSMUST00000126957 1731 ntTSL 5 BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Popdc3-202ENSMUST00000161803 1369 ntTSL 1 (best) BASIC20.84■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.83■□□□□ 0.93
Trem1Q9JKE2 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.83■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Fam136a-201ENSMUST00000071492 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.82■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Kcnc3-207ENSMUST00000209177 2960 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.81■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC20.8■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.8■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Hnrnpd-202ENSMUST00000072750 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.79■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Gm30346-201ENSMUST00000218641 1699 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.79■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Gkap1-201ENSMUST00000091579 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.78■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.77■□□□□ 0.92
Trem1Q9JKE2 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.77■□□□□ 0.91
Trem1Q9JKE2 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.76■□□□□ 0.91
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 54.6 ms