Protein–RNA interactions for Protein: Q9JKC8

Ap3m1, AP-3 complex subunit mu-1, mousemouse

Predictions only

Length 418 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ap3m1Q9JKC8 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3m1Q9JKC8 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ap3m1Q9JKC8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3m1Q9JKC8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3m1Q9JKC8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3m1Q9JKC8 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3m1Q9JKC8 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ap3m1Q9JKC8 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Ap3m1Q9JKC8 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Srsf9-201ENSMUST00000031513 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 AI837181-202ENSMUST00000159759 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ap3m1Q9JKC8 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.11■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Eif2ak3-204ENSMUST00000162950 927 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ap3m1Q9JKC8 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.08■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Gm10762-201ENSMUST00000099385 1133 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 2210008F06Rik-201ENSMUST00000180805 1082 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Ap3m1Q9JKC8 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 64.8 ms