Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJH1

Rnase4, Ribonuclease 4, mousemouse

Predictions only

Length 148 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rnase4Q9JJH1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Rnase4Q9JJH1 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Rnase4Q9JJH1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Plin1-206ENSMUST00000205915 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Ski-201ENSMUST00000030917 5522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Rnase4Q9JJH1 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Dut-202ENSMUST00000082122 1020 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Rnase4Q9JJH1 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Qk-201ENSMUST00000042296 6718 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Rnase4Q9JJH1 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.2 ms