Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHR9

Nrip2, Nuclear receptor-interacting protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nrip2Q9JHR9 Mcat-201ENSMUST00000061882 1893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Rnf130-202ENSMUST00000102776 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Gm5814-201ENSMUST00000177586 378 ntAPPRIS P1 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Nrip2Q9JHR9 Slc16a8-201ENSMUST00000039752 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Syt7-201ENSMUST00000073899 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Nrip2Q9JHR9 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.02■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Pitpna-205ENSMUST00000179445 1665 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Slc16a11-205ENSMUST00000126388 1938 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Bok-205ENSMUST00000201863 883 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Gsx2-202ENSMUST00000160104 1182 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Nrip2Q9JHR9 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 AC166822.3-201ENSMUST00000227394 661 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Bcl7c-201ENSMUST00000061468 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Mkrn1-202ENSMUST00000051671 1511 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Nrip2Q9JHR9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip2Q9JHR9 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip2Q9JHR9 Crk-202ENSMUST00000093115 965 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip2Q9JHR9 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip2Q9JHR9 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip2Q9JHR9 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Nrip2Q9JHR9 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.9 ms