Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHH9

Copz2, Coatomer subunit zeta-2, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Copz2Q9JHH9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Copz2Q9JHH9 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Copz2Q9JHH9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 B430219N15Rik-202ENSMUST00000180853 1105 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
Copz2Q9JHH9 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.44■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.43■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Copz2Q9JHH9 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms