Protein–RNA interactions for Protein: Q9JHE7

Tssc4, Protein TSSC4, mousemouse

Predictions only

Length 317 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tssc4Q9JHE7 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Tssc4Q9JHE7 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Amer2-203ENSMUST00000225247 2662 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Mypop-203ENSMUST00000131087 1951 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
Tssc4Q9JHE7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Tssc4Q9JHE7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 Hdgf-201ENSMUST00000005017 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Tssc4Q9JHE7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC23.03■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Tssc4Q9JHE7 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
Tssc4Q9JHE7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Tssc4Q9JHE7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Tssc4Q9JHE7 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.6 ms