Protein–RNA interactions for Protein: Q9ESX2

Sp6, Transcription factor Sp6, mousemouse

Predictions only

Length 376 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp6Q9ESX2 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Cacfd1-204ENSMUST00000114006 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Fkbp8-202ENSMUST00000119353 1720 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Sp6Q9ESX2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Sp6Q9ESX2 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 1700026D11Rik-201ENSMUST00000126910 2033 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Sp6Q9ESX2 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Rnf130-201ENSMUST00000054684 1415 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Sp6Q9ESX2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 107.7 ms