Protein–RNA interactions for Protein: Q9ES46

Parvb, Beta-parvin, mousemouse

Predictions only

Length 365 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ParvbQ9ES46 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
ParvbQ9ES46 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
ParvbQ9ES46 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.33■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.32■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
ParvbQ9ES46 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
ParvbQ9ES46 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ParvbQ9ES46 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
ParvbQ9ES46 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
ParvbQ9ES46 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
ParvbQ9ES46 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ParvbQ9ES46 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
ParvbQ9ES46 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ParvbQ9ES46 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
ParvbQ9ES46 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
ParvbQ9ES46 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ParvbQ9ES46 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
ParvbQ9ES46 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
ParvbQ9ES46 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
ParvbQ9ES46 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.7 ms