Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERV1

Mkrn2, Probable E3 ubiquitin-protein ligase makorin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 416 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mkrn2Q9ERV1 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
Mkrn2Q9ERV1 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mkrn2Q9ERV1 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mkrn2Q9ERV1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mkrn2Q9ERV1 Kansl2-202ENSMUST00000116400 2110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mkrn2Q9ERV1 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
Mkrn2Q9ERV1 Cnot6l-203ENSMUST00000122003 2089 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
Mkrn2Q9ERV1 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.67■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC25.67■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.66■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC25.65■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Mkrn2Q9ERV1 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Mkrn2Q9ERV1 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC25.63■■□□□ 1.69
Mkrn2Q9ERV1 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mkrn2Q9ERV1 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mkrn2Q9ERV1 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Mkrn2Q9ERV1 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Mkrn2Q9ERV1 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mkrn2Q9ERV1 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mkrn2Q9ERV1 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mkrn2Q9ERV1 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Mkrn2Q9ERV1 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Mkrn2Q9ERV1 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC25.54■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Mkrn2Q9ERV1 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC25.48■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Mkrn2Q9ERV1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Mkrn2Q9ERV1 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mkrn2Q9ERV1 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mkrn2Q9ERV1 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.38■■□□□ 1.65
Mkrn2Q9ERV1 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mkrn2Q9ERV1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mkrn2Q9ERV1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Mkrn2Q9ERV1 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mkrn2Q9ERV1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Mkrn2Q9ERV1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Mkrn2Q9ERV1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Mkrn2Q9ERV1 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.2 ms