Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERS2

Ndufa13, NADH dehydrogenase [ubiquinone] 1 alpha subcomplex subunit 13, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ndufa13Q9ERS2 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Gpr137c-202ENSMUST00000147957 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Ndufa13Q9ERS2 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Abhd17a-201ENSMUST00000003436 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Dhrs13-203ENSMUST00000122342 1791 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Rbms1-202ENSMUST00000112509 1806 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Rexo2-201ENSMUST00000034524 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Ndufa13Q9ERS2 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Hmx1-201ENSMUST00000087674 1526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Homer3-203ENSMUST00000110124 2445 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Ndufa13Q9ERS2 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Ube2m-201ENSMUST00000005714 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Mxi1-202ENSMUST00000025998 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Bok-201ENSMUST00000027499 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Ywhaq-202ENSMUST00000103002 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Ndufa13Q9ERS2 Rheb-201ENSMUST00000030787 1784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Cenpv-201ENSMUST00000018653 1032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Ndufa13Q9ERS2 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms