Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER65

Clstn2, Calsyntenin-2, mousemouse

Predictions only

Length 966 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clstn2Q9ER65 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.72■■■■□ 3.15
Clstn2Q9ER65 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC34.71■■■■□ 3.15
Clstn2Q9ER65 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.7■■■■□ 3.15
Clstn2Q9ER65 Lrfn1-203ENSMUST00000189877 1852 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC34.69■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.68■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC34.67■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.67■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC34.67■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC34.66■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.66■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC34.66■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 Ctbp1-201ENSMUST00000079746 2279 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.65■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 Rras2-201ENSMUST00000069449 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.64■■■■□ 3.14
Clstn2Q9ER65 4921531C22Rik-201ENSMUST00000150145 1905 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC34.63■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Ywhaz-204ENSMUST00000110362 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.63■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC34.62■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC34.61■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Gm43445-201ENSMUST00000198564 2091 ntBASIC34.6■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.6■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC34.59■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.59■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.58■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.13
Clstn2Q9ER65 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Eed-201ENSMUST00000107234 2067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.57■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.56■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.56■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC34.56■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC34.55■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.54■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.53■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC34.52■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC34.52■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.51■■■■□ 3.12
Clstn2Q9ER65 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Clstn2Q9ER65 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Clstn2Q9ER65 A830010M20Rik-202ENSMUST00000094541 1134 ntTSL 5 BASIC34.49■■■■□ 3.11
Clstn2Q9ER65 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC34.49■■■■□ 3.11
Clstn2Q9ER65 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC34.48■■■■□ 3.11
Clstn2Q9ER65 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Clstn2Q9ER65 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC34.47■■■■□ 3.11
Clstn2Q9ER65 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC34.47■■■■□ 3.11
Clstn2Q9ER65 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC34.46■■■■□ 3.11
Clstn2Q9ER65 Tmeff1-201ENSMUST00000030032 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Clstn2Q9ER65 Caap1-201ENSMUST00000030313 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.46■■■■□ 3.11
Clstn2Q9ER65 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC34.45■■■■□ 3.11
Clstn2Q9ER65 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Clstn2Q9ER65 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Clstn2Q9ER65 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC34.44■■■■□ 3.1
Clstn2Q9ER65 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC34.44■■■■□ 3.1
Clstn2Q9ER65 Hnrnpa0-201ENSMUST00000007980 2678 ntAPPRIS P1 BASIC34.42■■■■□ 3.1
Clstn2Q9ER65 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Clstn2Q9ER65 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Clstn2Q9ER65 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC34.41■■■■□ 3.1
Clstn2Q9ER65 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC34.4■■■■□ 3.1
Clstn2Q9ER65 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC34.39■■■■□ 3.1
Clstn2Q9ER65 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Clstn2Q9ER65 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC34.39■■■■□ 3.1
Clstn2Q9ER65 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC34.38■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.38■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC34.36■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC34.35■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC34.34■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.33■■■■□ 3.09
Clstn2Q9ER65 Nr2f6-201ENSMUST00000002466 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Clstn2Q9ER65 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Clstn2Q9ER65 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC34.31■■■■□ 3.08
Clstn2Q9ER65 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Clstn2Q9ER65 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC34.3■■■■□ 3.08
Clstn2Q9ER65 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.3■■■■□ 3.08
Clstn2Q9ER65 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.29■■■■□ 3.08
Clstn2Q9ER65 Galnt12-201ENSMUST00000045041 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Clstn2Q9ER65 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC34.27■■■■□ 3.08
Clstn2Q9ER65 Kcnip2-208ENSMUST00000161886 693 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.26■■■■□ 3.08
Clstn2Q9ER65 Mpp6-203ENSMUST00000166318 2222 ntTSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.25■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 Ryk-203ENSMUST00000175883 2505 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC34.24■■■■□ 3.07
Clstn2Q9ER65 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC34.24■■■■□ 3.07
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.6 ms