Protein–RNA interactions for Protein: Q9ER00

Stx12, Syntaxin-12, mousemouse

Predictions only

Length 274 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Stx12Q9ER00 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx12Q9ER00 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Stx12Q9ER00 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx12Q9ER00 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx12Q9ER00 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Stx12Q9ER00 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx12Q9ER00 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Stx12Q9ER00 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx12Q9ER00 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx12Q9ER00 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Stx12Q9ER00 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Stx12Q9ER00 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Il17rd-202ENSMUST00000223942 2186 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Stx12Q9ER00 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
Stx12Q9ER00 Gm26115-201ENSMUST00000175605 87 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Sugct-202ENSMUST00000220514 1351 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Stx12Q9ER00 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Nelfe-204ENSMUST00000173357 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Stx12Q9ER00 Gm527-201ENSMUST00000058135 1468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.6 ms