Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ48

V1ra8, Vomeronasal type-1 receptor A8, mousemouse

Predictions only

Length 279 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
V1ra8Q9EQ48 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.06■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.05■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Plvap-201ENSMUST00000048452 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC18.03■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC18.02■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
V1ra8Q9EQ48 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Gtpbp2-201ENSMUST00000024748 2966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Slc1a5-201ENSMUST00000108496 2764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Snf8-202ENSMUST00000107700 849 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
V1ra8Q9EQ48 Tmed7-203ENSMUST00000151189 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Exosc6-201ENSMUST00000210390 1326 ntAPPRIS P1 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC17.91■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.91■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Ndufaf6-201ENSMUST00000058183 1082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.9■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.9■□□□□ 0.46
V1ra8Q9EQ48 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC17.89■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Coq10a-207ENSMUST00000220227 1434 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.89■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC17.88■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.88■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
V1ra8Q9EQ48 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.84■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.9 ms