Protein–RNA interactions for Protein: Q9EQ41

Vmn1r29, Vomeronasal type-1 receptor, mousemouse

Predictions only

Length 303 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vmn1r29Q9EQ41 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC21.78■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.77■■□□□ 1.08
Vmn1r29Q9EQ41 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Cdv3-205ENSMUST00000189896 1023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Dusp7-201ENSMUST00000172306 3213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vmn1r29Q9EQ41 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 1190005I06Rik-201ENSMUST00000123927 844 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Pard6a-205ENSMUST00000212430 1261 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Gltp-203ENSMUST00000112214 944 ntTSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vmn1r29Q9EQ41 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Tbc1d25-203ENSMUST00000143984 2184 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Mthfd2l-203ENSMUST00000202781 688 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Vmn1r29Q9EQ41 C2cd4d-201ENSMUST00000169433 1321 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC21.57■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Vmn1r29Q9EQ41 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
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