Protein–RNA interactions for Protein: Q9DCJ1

Mlst8, Target of rapamycin complex subunit LST8, mousemouse

Predictions only

Length 326 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mlst8Q9DCJ1 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Rnf149-201ENSMUST00000062525 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Mlst8Q9DCJ1 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.39■□□□□ 0.54
Mlst8Q9DCJ1 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mlst8Q9DCJ1 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 CT030161.2-201ENSMUST00000218666 735 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Mlst8Q9DCJ1 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mlst8Q9DCJ1 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mlst8Q9DCJ1 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mlst8Q9DCJ1 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mlst8Q9DCJ1 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mlst8Q9DCJ1 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mlst8Q9DCJ1 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mlst8Q9DCJ1 March2-205ENSMUST00000173015 1418 ntTSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mlst8Q9DCJ1 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mlst8Q9DCJ1 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mlst8Q9DCJ1 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.5 ms