Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBR7

Ppp1r12a, Protein phosphatase 1 regulatory subunit 12A, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,029 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ppp1r12aQ9DBR7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r12aQ9DBR7 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r12aQ9DBR7 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r12aQ9DBR7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r12aQ9DBR7 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r12aQ9DBR7 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Ppp1r12aQ9DBR7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r12aQ9DBR7 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r12aQ9DBR7 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r12aQ9DBR7 Crip2-201ENSMUST00000084882 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r12aQ9DBR7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Ppp1r12aQ9DBR7 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.31■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
Ppp1r12aQ9DBR7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.21■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
Ppp1r12aQ9DBR7 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 C1qtnf5-201ENSMUST00000114815 1215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Gas2l1-201ENSMUST00000037146 2686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Ppp1r12aQ9DBR7 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Ppp1r12aQ9DBR7 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Ppp1r12aQ9DBR7 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35 ms