Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBP5

Cmpk1, UMP-CMP kinase, mousemouse

Predictions only

Length 196 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cmpk1Q9DBP5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmpk1Q9DBP5 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Cmpk1Q9DBP5 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmpk1Q9DBP5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmpk1Q9DBP5 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
Cmpk1Q9DBP5 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC22.63■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC22.61■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Cmpk1Q9DBP5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmpk1Q9DBP5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Cmpk1Q9DBP5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Cmpk1Q9DBP5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmpk1Q9DBP5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Cmpk1Q9DBP5 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmpk1Q9DBP5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmpk1Q9DBP5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Cmpk1Q9DBP5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Cmpk1Q9DBP5 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmpk1Q9DBP5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
Cmpk1Q9DBP5 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmpk1Q9DBP5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Cmpk1Q9DBP5 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmpk1Q9DBP5 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmpk1Q9DBP5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Cmpk1Q9DBP5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmpk1Q9DBP5 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Cmpk1Q9DBP5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmpk1Q9DBP5 Nucks1-203ENSMUST00000189946 2375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Cmpk1Q9DBP5 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC22.46■■□□□ 1.19
Cmpk1Q9DBP5 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Cmpk1Q9DBP5 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Cmpk1Q9DBP5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Cmpk1Q9DBP5 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmpk1Q9DBP5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmpk1Q9DBP5 En1-201ENSMUST00000079721 2624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Cmpk1Q9DBP5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmpk1Q9DBP5 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Cmpk1Q9DBP5 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmpk1Q9DBP5 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmpk1Q9DBP5 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
Cmpk1Q9DBP5 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.1 ms