Protein–RNA interactions for Protein: Q9DBC0

Selenoo, Selenoprotein O, mousemouse

Predictions only

Length 667 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SelenooQ9DBC0 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
SelenooQ9DBC0 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
SelenooQ9DBC0 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Slc22a17-201ENSMUST00000050772 2290 ntTSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Mypop-201ENSMUST00000059331 2173 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 AC157572.2-201ENSMUST00000226970 908 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC25.91■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Cd320-201ENSMUST00000002379 2209 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.91■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 B4galt2-201ENSMUST00000030266 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
SelenooQ9DBC0 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Hoxd9-201ENSMUST00000059272 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Deaf1-201ENSMUST00000080553 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 1810026B05Rik-206ENSMUST00000187421 519 ntTSL 3 BASIC25.86■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Tdp2-203ENSMUST00000223804 1136 ntBASIC25.83■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
SelenooQ9DBC0 Slc25a33-201ENSMUST00000105686 1887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Stard3nl-210ENSMUST00000222869 1030 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Epop-201ENSMUST00000052281 2314 ntAPPRIS P1 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC25.82■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC25.82■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Qrich1-209ENSMUST00000194385 975 ntTSL 2 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.81■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC25.81■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC25.8■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Gm9397-201ENSMUST00000200125 605 ntBASIC25.8■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Kctd15-202ENSMUST00000108069 2407 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Lsm4-204ENSMUST00000210071 575 ntTSL 5 BASIC25.79■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC25.79■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC25.78■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Homer3-201ENSMUST00000003669 2323 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Cln6-201ENSMUST00000034776 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.78■■□□□ 1.72
SelenooQ9DBC0 Ei24-201ENSMUST00000115086 2220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Sdccag3-202ENSMUST00000077983 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC25.75■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Fam181b-201ENSMUST00000051179 2003 ntAPPRIS P1 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Gm24970-201ENSMUST00000175582 82 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC25.73■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Cdr2-201ENSMUST00000033169 2525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Egr4-201ENSMUST00000095759 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
SelenooQ9DBC0 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Tmem243-201ENSMUST00000115365 1040 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
SelenooQ9DBC0 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.5 ms