Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAW6

Prpf4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 521 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Prpf4Q9DAW6 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Prpf4Q9DAW6 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Fgf20-201ENSMUST00000034014 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Gm266-201ENSMUST00000010673 1215 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Hoxa13-201ENSMUST00000047993 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Kcnq5-206ENSMUST00000173404 2775 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Smox-201ENSMUST00000028806 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Prpf4Q9DAW6 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Cpsf4-201ENSMUST00000070487 1606 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Ctage5-218ENSMUST00000177162 2728 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Dnttip1-202ENSMUST00000109326 476 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Yif1b-202ENSMUST00000108237 1086 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Zmynd12-201ENSMUST00000094819 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Ran-202ENSMUST00000111343 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Kansl1l-202ENSMUST00000113987 2342 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Prpf4Q9DAW6 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Eid2-201ENSMUST00000059596 1392 ntAPPRIS P1 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Il3ra-201ENSMUST00000090591 1614 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Gm26508-201ENSMUST00000181285 1516 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Mkrn1-203ENSMUST00000114822 751 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Prpf4Q9DAW6 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Dusp5-201ENSMUST00000038287 2473 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Msi2-202ENSMUST00000107908 695 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Stard10-203ENSMUST00000164479 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Tmeff1-202ENSMUST00000123476 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Ccdc122-202ENSMUST00000095625 1195 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 P2rx2-205ENSMUST00000200037 1569 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Capns1-201ENSMUST00000001845 1600 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 1700028N14Rik-201ENSMUST00000139621 747 ntTSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Dleu2-206ENSMUST00000182537 318 ntTSL 2 BASIC24.33■■□□□ 1.49
Prpf4Q9DAW6 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC24.32■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Fam60a-203ENSMUST00000111562 906 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Agpat5-201ENSMUST00000033847 2841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Prph-202ENSMUST00000047104 1865 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Kcnc3-206ENSMUST00000208651 2728 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Pm20d2-201ENSMUST00000098181 1445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Fance-203ENSMUST00000114803 1980 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Hoxb3-202ENSMUST00000093944 3190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
Prpf4Q9DAW6 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.1 ms