Protein–RNA interactions for Protein: Q9DA47

Tmem239, Transmembrane protein 239, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem239Q9DA47 Olfm1-203ENSMUST00000102879 1072 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 5031439G07Rik-203ENSMUST00000165743 5032 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC18.55■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Larp4b-204ENSMUST00000188939 2658 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
Tmem239Q9DA47 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Twist1-201ENSMUST00000049089 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 St7-205ENSMUST00000081635 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Vsig8-202ENSMUST00000177086 1519 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Cebpb-201ENSMUST00000070642 1504 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Fam212b-202ENSMUST00000098273 1868 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Tmem239Q9DA47 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Gm17082-201ENSMUST00000166043 1091 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Stau2-210ENSMUST00000149320 2214 ntTSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Kctd5-201ENSMUST00000017090 2443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Reep6-203ENSMUST00000105355 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Reep6-204ENSMUST00000105357 2127 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Dapk3-202ENSMUST00000178422 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Ino80b-201ENSMUST00000032109 1038 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Sept11-208ENSMUST00000202308 1792 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Slc16a11-201ENSMUST00000094055 1788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Hdac2-201ENSMUST00000019911 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Fbll1-201ENSMUST00000160726 1503 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Nrxn2-208ENSMUST00000137166 6314 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Mafa-201ENSMUST00000062002 1080 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Eif4e2-203ENSMUST00000113230 1569 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Artn-201ENSMUST00000070816 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Gm11613-201ENSMUST00000134427 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Tfeb-202ENSMUST00000086932 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 A730013G03Rik-202ENSMUST00000195012 2097 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Enho-201ENSMUST00000127306 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Gm8109-201ENSMUST00000194076 746 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Fam69b-201ENSMUST00000074240 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Tmem239Q9DA47 Mrps7-201ENSMUST00000058109 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Tmem239Q9DA47 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 74.5 ms