Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8T4

Tvp23b, Golgi apparatus membrane protein TVP23 homolog B, mousemouse

Predictions only

Length 205 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tvp23bQ9D8T4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Tvp23bQ9D8T4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Scrt2-201ENSMUST00000064061 3395 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Tvp23bQ9D8T4 AC163623.1-201ENSMUST00000213738 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Gm42809-201ENSMUST00000198429 1138 ntBASIC21.85■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.85■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.84■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.83■■□□□ 1.09
Tvp23bQ9D8T4 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.83■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Pura-201ENSMUST00000051301 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.82■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.81■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Tvp23bQ9D8T4 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.74■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Tvp23bQ9D8T4 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Tvp23bQ9D8T4 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.6 ms