Protein–RNA interactions for Protein: Q9D8E6

Rpl4, 60S ribosomal protein L4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 419 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rpl4Q9D8E6 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Slc35a3-202ENSMUST00000120120 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Dda1-209ENSMUST00000147642 1865 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Tpst1-201ENSMUST00000040721 2050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Rpl4Q9D8E6 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Aspscr1-201ENSMUST00000026135 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.11■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 B4galt7-202ENSMUST00000100764 2195 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Galnt10-202ENSMUST00000108846 1745 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Upp2-202ENSMUST00000071543 2150 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Rpl4Q9D8E6 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Zxda-201ENSMUST00000117281 2621 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Mogs-201ENSMUST00000032114 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Apcdd1-202ENSMUST00000163716 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Rpl4Q9D8E6 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Rpl4Q9D8E6 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Ddrgk1-201ENSMUST00000089559 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Rpl4Q9D8E6 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl4Q9D8E6 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Rpl4Q9D8E6 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Rpl4Q9D8E6 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms