Protein–RNA interactions for Protein: Q9D898

Arpc5l, Actin-related protein 2/3 complex subunit 5-like protein, mousemouse

Predictions only

Length 153 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arpc5lQ9D898 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arpc5lQ9D898 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.42■□□□□ 0.86
Arpc5lQ9D898 Gm6345-201ENSMUST00000180378 1691 ntBASIC20.42■□□□□ 0.86
Arpc5lQ9D898 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arpc5lQ9D898 Agap3-206ENSMUST00000212381 1191 ntTSL 5 BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arpc5lQ9D898 Foxg1-201ENSMUST00000021333 2941 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.41■□□□□ 0.86
Arpc5lQ9D898 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC20.41■□□□□ 0.86
Arpc5lQ9D898 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arpc5lQ9D898 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arpc5lQ9D898 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.4■□□□□ 0.86
Arpc5lQ9D898 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC20.39■□□□□ 0.86
Arpc5lQ9D898 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC20.39■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC20.38■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Ssbp3-202ENSMUST00000072753 1924 ntTSL 1 (best) BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 1110032F04Rik-201ENSMUST00000054551 2578 ntAPPRIS P1 BASIC20.37■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Mpp6-202ENSMUST00000036236 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Srsf1-201ENSMUST00000079866 2948 ntTSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Iqck-206ENSMUST00000208658 2891 ntBASIC20.36■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.36■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Mapk3-202ENSMUST00000057669 1800 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Shf-201ENSMUST00000048635 1431 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.35■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Baiap2-205ENSMUST00000106233 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC20.34■□□□□ 0.85
Arpc5lQ9D898 Crlf1-201ENSMUST00000008032 1644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.33■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.32■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.31■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.3■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Smarcc1-203ENSMUST00000197480 1949 ntTSL 1 (best) BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.29■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.28■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC20.27■□□□□ 0.84
Arpc5lQ9D898 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.26■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.25■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Dpf1-204ENSMUST00000108231 2040 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Gnas-207ENSMUST00000109085 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Ppp2r5a-201ENSMUST00000067976 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Arpc5lQ9D898 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 St7-202ENSMUST00000052113 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Guf1-201ENSMUST00000031113 1769 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC20.18■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Efemp2-201ENSMUST00000070118 1781 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Mipep-204ENSMUST00000225043 1548 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Hnrnpd-203ENSMUST00000112939 1670 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Tcerg1l-201ENSMUST00000160436 2565 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Arpc5lQ9D898 Tbx1-201ENSMUST00000009241 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc5lQ9D898 Plpp2-201ENSMUST00000063879 1654 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc5lQ9D898 Smap2-201ENSMUST00000043200 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Arpc5lQ9D898 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arpc5lQ9D898 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Arpc5lQ9D898 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arpc5lQ9D898 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arpc5lQ9D898 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arpc5lQ9D898 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Arpc5lQ9D898 Tnfsfm13-202ENSMUST00000174159 1470 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Arpc5lQ9D898 Gal3st1-202ENSMUST00000078757 1749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 891.8 ms