Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7W5

Med8, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 8, mousemouse

Predictions only

Length 268 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med8Q9D7W5 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.8■■□□□ 1.08
Med8Q9D7W5 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC21.79■■□□□ 1.08
Med8Q9D7W5 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med8Q9D7W5 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC21.79■■□□□ 1.08
Med8Q9D7W5 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med8Q9D7W5 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med8Q9D7W5 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.78■■□□□ 1.08
Med8Q9D7W5 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med8Q9D7W5 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med8Q9D7W5 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.08
Med8Q9D7W5 Htra4-201ENSMUST00000084031 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.77■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Hmx3-201ENSMUST00000046093 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.76■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.75■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.73■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC21.7■■□□□ 1.07
Med8Q9D7W5 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med8Q9D7W5 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med8Q9D7W5 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC21.7■■□□□ 1.06
Med8Q9D7W5 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Med8Q9D7W5 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Med8Q9D7W5 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med8Q9D7W5 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med8Q9D7W5 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Med8Q9D7W5 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med8Q9D7W5 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Med8Q9D7W5 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.64■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC21.63■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.62■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC21.61■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC21.61■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.6■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.59■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.58■■□□□ 1.05
Med8Q9D7W5 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Lgi2-201ENSMUST00000039750 6456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Mnx1-201ENSMUST00000001608 2018 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Med8Q9D7W5 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Rragc-201ENSMUST00000030399 2593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Pan3-201ENSMUST00000031651 5048 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Zfp422-201ENSMUST00000057540 2375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Cic-202ENSMUST00000163320 6096 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Cic-201ENSMUST00000005578 6099 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Med8Q9D7W5 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms