Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7P7

Clic3, Chloride intracellular channel protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 237 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Clic3Q9D7P7 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Clic3Q9D7P7 Ranbp1-202ENSMUST00000115645 1085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Ubtd2-201ENSMUST00000051053 1012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Ube2f-202ENSMUST00000171112 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Tsc22d1-204ENSMUST00000110888 4999 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Usp12-201ENSMUST00000085614 4327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Rab22a-202ENSMUST00000109110 849 ntTSL 5 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Foxe1-201ENSMUST00000095097 2804 ntAPPRIS P1 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Clic3Q9D7P7 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Clic3Q9D7P7 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Dedd-204ENSMUST00000111300 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Aebp2-203ENSMUST00000095350 2575 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Clic3Q9D7P7 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic3Q9D7P7 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic3Q9D7P7 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic3Q9D7P7 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic3Q9D7P7 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic3Q9D7P7 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Clic3Q9D7P7 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic3Q9D7P7 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic3Q9D7P7 Dennd5a-202ENSMUST00000106722 4862 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Clic3Q9D7P7 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 10.9 ms