Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6Y9

Gbe1, 1,4-alpha-glucan-branching enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 702 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Gbe1Q9D6Y9 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Gbe1Q9D6Y9 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC23.27■■□□□ 1.32
Gbe1Q9D6Y9 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Gbe1Q9D6Y9 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Grasp-201ENSMUST00000000543 2013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Chrna5-204ENSMUST00000217408 2446 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
Gbe1Q9D6Y9 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Gm29254-202ENSMUST00000189302 883 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Gbe1Q9D6Y9 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbe1Q9D6Y9 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbe1Q9D6Y9 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbe1Q9D6Y9 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
Gbe1Q9D6Y9 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbe1Q9D6Y9 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
Gbe1Q9D6Y9 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
Gbe1Q9D6Y9 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbe1Q9D6Y9 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
Gbe1Q9D6Y9 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.8 ms