Protein–RNA interactions for Protein: Q9D6K8

Fundc2, FUN14 domain-containing protein 2, mousemouse

Predictions only

Length 151 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fundc2Q9D6K8 Triobp-206ENSMUST00000130663 1660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Nkx1-1-201ENSMUST00000173348 1209 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Gm5601-202ENSMUST00000207161 1437 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Ppp1cc-201ENSMUST00000086294 1442 ntTSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.47■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Mtch1-202ENSMUST00000118366 1867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Gm12184-201ENSMUST00000104959 1310 ntAPPRIS P1 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Fundc2Q9D6K8 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Stard10-202ENSMUST00000163799 1723 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 E330040D14Rik-201ENSMUST00000192299 1374 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Tlx3-201ENSMUST00000037746 1533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Tbcel-204ENSMUST00000128959 1535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Neurl4-201ENSMUST00000061837 5188 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
Fundc2Q9D6K8 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Mapk3-201ENSMUST00000050201 1267 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Pradc1-202ENSMUST00000113770 610 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Rbm17-201ENSMUST00000040314 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Mbd2-202ENSMUST00000114946 1290 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Gm27322-201ENSMUST00000184007 104 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Clec2l-201ENSMUST00000114874 1428 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Gm25262-201ENSMUST00000174934 133 ntBASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Asmt-201ENSMUST00000178693 1191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Fundc2Q9D6K8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.33■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.33■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Svbp-202ENSMUST00000097908 832 ntTSL 2 BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Fundc2Q9D6K8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.9 ms