Protein–RNA interactions for Protein: Q9D518

Fam227b, Protein FAM227B, mousemouse

Predictions only

Length 532 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fam227bQ9D518 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
Fam227bQ9D518 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.19■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.46
Fam227bQ9D518 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Gfra4-203ENSMUST00000110234 600 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Gfra4-204ENSMUST00000110235 573 ntTSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Fam227bQ9D518 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC24.08■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.02■■□□□ 1.44
Fam227bQ9D518 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.01■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.95■■□□□ 1.43
Fam227bQ9D518 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Fam227bQ9D518 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.5 ms