Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4V4

Taf1d, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit D, mousemouse

Predictions only

Length 322 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Taf1dQ9D4V4 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC29.48■■■□□ 2.31
Taf1dQ9D4V4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Taf1dQ9D4V4 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Taf1dQ9D4V4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC29.47■■■□□ 2.31
Taf1dQ9D4V4 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Taf1dQ9D4V4 Dlx4-201ENSMUST00000021241 2282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Taf1dQ9D4V4 Stk24-201ENSMUST00000079817 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.47■■■□□ 2.31
Taf1dQ9D4V4 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Taf1dQ9D4V4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Taf1dQ9D4V4 Gm26588-201ENSMUST00000181064 2098 ntTSL 1 (best) BASIC29.46■■■□□ 2.31
Taf1dQ9D4V4 Pfn2-202ENSMUST00000119344 1879 ntTSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.31
Taf1dQ9D4V4 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.45■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 Tpm1-216ENSMUST00000113707 1898 ntTSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 Susd4-202ENSMUST00000153348 1898 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.44■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.44■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.43■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.42■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 Pcf11-205ENSMUST00000208255 1720 ntBASIC29.42■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC29.41■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 Gm5067-201ENSMUST00000170449 1009 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 Gm6658-202ENSMUST00000209493 1885 ntBASIC29.41■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.4■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.39■■■□□ 2.3
Taf1dQ9D4V4 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC29.38■■■□□ 2.29
Taf1dQ9D4V4 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC29.37■■■□□ 2.29
Taf1dQ9D4V4 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Taf1dQ9D4V4 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.37■■■□□ 2.29
Taf1dQ9D4V4 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Taf1dQ9D4V4 Hsd17b11-201ENSMUST00000031251 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.36■■■□□ 2.29
Taf1dQ9D4V4 Dcaf15-202ENSMUST00000210279 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Taf1dQ9D4V4 Lmo4-201ENSMUST00000120539 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Taf1dQ9D4V4 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.33■■■□□ 2.29
Taf1dQ9D4V4 Ring1-201ENSMUST00000025183 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.33■■■□□ 2.29
Taf1dQ9D4V4 Runx3-202ENSMUST00000119564 1855 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.32■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Hnrnpk-210ENSMUST00000176558 1053 ntTSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Kiss1-201ENSMUST00000007433 779 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC29.32■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.31■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Dapk3-201ENSMUST00000047665 1676 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.3■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC29.29■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Ywhah-201ENSMUST00000019109 1764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.29■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.28■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Tmco6-201ENSMUST00000007046 1817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC29.27■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.27■■■□□ 2.28
Taf1dQ9D4V4 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC29.26■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 Rtn2-201ENSMUST00000032559 1990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 Kiss1-202ENSMUST00000178033 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC29.25■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC29.24■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 Tspan33-201ENSMUST00000046750 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC29.24■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 Hoxa13-203ENSMUST00000147595 2395 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.23■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 Ttc19-202ENSMUST00000101075 2193 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.22■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC29.21■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.21■■■□□ 2.27
Taf1dQ9D4V4 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC29.2■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC29.19■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC29.19■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC29.18■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.18■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.17■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC29.16■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC29.16■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC29.15■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC29.15■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.15■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.14■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC29.14■■■□□ 2.26
Taf1dQ9D4V4 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC29.13■■■□□ 2.25
Taf1dQ9D4V4 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC29.13■■■□□ 2.25
Taf1dQ9D4V4 Neurl1b-202ENSMUST00000182897 1231 ntTSL 5 BASIC29.13■■■□□ 2.25
Taf1dQ9D4V4 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC29.12■■■□□ 2.25
Taf1dQ9D4V4 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC29.11■■■□□ 2.25
Taf1dQ9D4V4 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC29.11■■■□□ 2.25
Taf1dQ9D4V4 Gm20109-201ENSMUST00000180802 671 ntTSL 1 (best) BASIC29.1■■■□□ 2.25
Taf1dQ9D4V4 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC29.1■■■□□ 2.25
Taf1dQ9D4V4 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC29.09■■■□□ 2.25
Taf1dQ9D4V4 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC29.09■■■□□ 2.25
Taf1dQ9D4V4 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC29.07■■■□□ 2.24
Taf1dQ9D4V4 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Taf1dQ9D4V4 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Taf1dQ9D4V4 Mapkapk5-201ENSMUST00000031410 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Taf1dQ9D4V4 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC29.07■■■□□ 2.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 9.7 ms