Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4U4

H2al3, H2A histone family member L3, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2al3Q9D4U4 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Gm20503-201ENSMUST00000174664 1294 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC19■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 2510039O18Rik-201ENSMUST00000103232 2731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
H2al3Q9D4U4 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Ctnnd2-201ENSMUST00000081728 5944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Ildr2-206ENSMUST00000194964 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Smurf1-203ENSMUST00000110677 5420 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Znrf2-201ENSMUST00000079869 5886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
H2al3Q9D4U4 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Eya2-202ENSMUST00000088132 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Crim1-201ENSMUST00000112498 5995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Ccdc122-201ENSMUST00000048208 1721 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Snta1-202ENSMUST00000109728 2131 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Snta1-201ENSMUST00000028991 2125 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.85■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
H2al3Q9D4U4 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Tead1-203ENSMUST00000084705 2543 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 4932443I19Rik-201ENSMUST00000166277 799 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Gtf2a2-203ENSMUST00000119413 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 P3h4-201ENSMUST00000066489 2178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.8■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Heca-201ENSMUST00000037879 5098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.79■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 2810459M11Rik-201ENSMUST00000027429 1225 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Fam174a-201ENSMUST00000059975 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC18.78■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Foxd2-201ENSMUST00000068654 2592 ntAPPRIS P1 BASIC18.77■□□□□ 0.6
H2al3Q9D4U4 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Gm15688-201ENSMUST00000161394 2418 ntTSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Foxk2-201ENSMUST00000106113 5029 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Cdc42bpg-201ENSMUST00000025681 5995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.76■□□□□ 0.59
H2al3Q9D4U4 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC18.75■□□□□ 0.59
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.3 ms