Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4H7

Lonrf3, LON peptidase N-terminal domain and RING finger protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 753 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lonrf3Q9D4H7 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.48■■□□□ 1.99
Lonrf3Q9D4H7 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lonrf3Q9D4H7 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.47■■□□□ 1.99
Lonrf3Q9D4H7 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lonrf3Q9D4H7 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.46■■□□□ 1.99
Lonrf3Q9D4H7 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC27.46■■□□□ 1.99
Lonrf3Q9D4H7 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 Terf2-203ENSMUST00000116425 2471 ntTSL 1 (best) BASIC27.45■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC27.44■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.44■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC27.43■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.42■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC27.41■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.4■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.39■■□□□ 1.98
Lonrf3Q9D4H7 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.38■■□□□ 1.97
Lonrf3Q9D4H7 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.37■■□□□ 1.97
Lonrf3Q9D4H7 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lonrf3Q9D4H7 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.36■■□□□ 1.97
Lonrf3Q9D4H7 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lonrf3Q9D4H7 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lonrf3Q9D4H7 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC27.35■■□□□ 1.97
Lonrf3Q9D4H7 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.33■■□□□ 1.97
Lonrf3Q9D4H7 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lonrf3Q9D4H7 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.32■■□□□ 1.96
Lonrf3Q9D4H7 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lonrf3Q9D4H7 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC27.3■■□□□ 1.96
Lonrf3Q9D4H7 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.29■■□□□ 1.96
Lonrf3Q9D4H7 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lonrf3Q9D4H7 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lonrf3Q9D4H7 Ppp1r14c-202ENSMUST00000217573 2013 ntTSL 1 (best) BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lonrf3Q9D4H7 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lonrf3Q9D4H7 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.28■■□□□ 1.96
Lonrf3Q9D4H7 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.27■■□□□ 1.96
Lonrf3Q9D4H7 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.26■■□□□ 1.96
Lonrf3Q9D4H7 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC27.25■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Plekha3-201ENSMUST00000111920 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC27.24■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Cbln1-201ENSMUST00000034076 2800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Ccnyl1-203ENSMUST00000187170 1506 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.23■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC27.22■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Cnnm3-201ENSMUST00000001166 5193 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC27.22■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.21■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.2■■□□□ 1.95
Lonrf3Q9D4H7 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC27.2■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 Gm16764-201ENSMUST00000138891 541 ntTSL 5 BASIC27.19■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.17■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 AC167019.3-201ENSMUST00000228225 1266 ntBASIC27.17■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 Mef2a-201ENSMUST00000032776 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC27.16■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 Cxxc4-203ENSMUST00000181904 5694 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC27.15■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.15■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 Pard6a-203ENSMUST00000211888 1179 ntTSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.94
Lonrf3Q9D4H7 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.14■■□□□ 1.93
Lonrf3Q9D4H7 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC27.13■■□□□ 1.93
Lonrf3Q9D4H7 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC27.13■■□□□ 1.93
Lonrf3Q9D4H7 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lonrf3Q9D4H7 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.12■■□□□ 1.93
Lonrf3Q9D4H7 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lonrf3Q9D4H7 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC27.11■■□□□ 1.93
Lonrf3Q9D4H7 Dyrk1a-202ENSMUST00000119878 5759 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.09■■□□□ 1.93
Lonrf3Q9D4H7 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lonrf3Q9D4H7 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lonrf3Q9D4H7 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC27.08■■□□□ 1.93
Lonrf3Q9D4H7 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.08■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Phf23-201ENSMUST00000018716 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Gxylt1-202ENSMUST00000057896 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Gm11175-201ENSMUST00000116172 543 ntBASIC27.07■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Mad2l2-202ENSMUST00000084129 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.07■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 AC158592.1-201ENSMUST00000215560 1113 ntTSL 5 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.06■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Suds3-201ENSMUST00000086471 2425 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Lonrf3Q9D4H7 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC27.05■■□□□ 1.92
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 66.3 ms