Protein–RNA interactions for Protein: Q9D3X4

4933428G20Rik, RIKEN cDNA 4933428G20 gene, mousemouse

Predictions only

Length 101 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933428G20RikQ9D3X4 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Itgb4-210ENSMUST00000169928 6160 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Kdm2a-203ENSMUST00000116571 2413 ntTSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Chrna5-202ENSMUST00000213960 1737 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.43□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.43□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Mark2-202ENSMUST00000032557 4488 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC8.42□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Jdp2-203ENSMUST00000177587 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Fam117a-201ENSMUST00000037502 2317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.42□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Ptprs-201ENSMUST00000067538 6855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Ap1g1-202ENSMUST00000093157 6899 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Ppp1r3e-202ENSMUST00000177403 1957 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.41□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Mta3-202ENSMUST00000112349 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Uhmk1-201ENSMUST00000027979 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Ythdf1-202ENSMUST00000108876 2272 ntTSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.41□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Snx24-202ENSMUST00000165032 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Sh3glb2-214ENSMUST00000163668 1733 ntTSL 5 BASIC8.4□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 G6pc3-202ENSMUST00000078975 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Pde3b-201ENSMUST00000032909 6573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Pkig-201ENSMUST00000064703 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Dazap1-203ENSMUST00000105362 2081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.06
4933428G20RikQ9D3X4 Braf-201ENSMUST00000002487 9728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.4□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Atoh7-201ENSMUST00000044059 1629 ntAPPRIS P1 BASIC8.4□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Reep6-202ENSMUST00000105354 2208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Reep6-205ENSMUST00000105358 2208 ntTSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Ankib1-201ENSMUST00000043551 6426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Arl2bp-201ENSMUST00000034228 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Sdk1-202ENSMUST00000085774 10352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.39□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.39□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 St8sia1-201ENSMUST00000032421 8991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 C330011M18Rik-201ENSMUST00000071067 1849 ntTSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem214-202ENSMUST00000201203 6110 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.38□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC8.37□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Gsk3a-201ENSMUST00000071739 2260 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC8.37□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Fezf2-202ENSMUST00000224023 1917 ntBASIC8.37□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Rab40c-201ENSMUST00000026826 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Ssx2ip-202ENSMUST00000106149 2416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Pias2-202ENSMUST00000114777 4968 ntTSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Trabd-203ENSMUST00000165690 1941 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.37□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Eml4-203ENSMUST00000112363 5238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC8.36□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Zfp787-201ENSMUST00000094870 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.36□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.35□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Lemd2-201ENSMUST00000055117 2595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Cmtm4-201ENSMUST00000179802 7734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Arhgap22-201ENSMUST00000111955 2148 ntTSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Gm27325-201ENSMUST00000175467 74 ntBASIC8.35□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1h-205ENSMUST00000159610 8230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Cacna1h-201ENSMUST00000078496 8220 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Ank1-203ENSMUST00000110688 7206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.35□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Calm3-201ENSMUST00000019514 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Adcy3-202ENSMUST00000124505 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Mgea5-201ENSMUST00000026243 5024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Gm25238-201ENSMUST00000174914 89 ntBASIC8.34□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Rnf149-204ENSMUST00000195705 389 ntTSL 3 BASIC8.34□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Cyp26a1-201ENSMUST00000025946 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.07
4933428G20RikQ9D3X4 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.34□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Mon2-207ENSMUST00000219203 1844 ntTSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Fgf18-201ENSMUST00000020507 1086 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 E2f4-201ENSMUST00000015003 1993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Cacng8-201ENSMUST00000092351 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC8.33□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Brd1-201ENSMUST00000088911 4702 ntTSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Mmp15-201ENSMUST00000034243 5135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Gdf7-201ENSMUST00000037313 1423 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC8.32□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Mtch1-201ENSMUST00000095427 1922 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Jph1-201ENSMUST00000038382 4809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC8.32□□□□□ -1.08
4933428G20RikQ9D3X4 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC8.31□□□□□ -1.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 15.4 ms