Protein–RNA interactions for Protein: Q9D308

9030624G23Rik, RIKEN cDNA 9030624G23 gene, mousemouse

Predictions only

Length 155 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
9030624G23RikQ9D308 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Cdkn2c-202ENSMUST00000097921 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Frat2-201ENSMUST00000059231 2161 ntAPPRIS P1 BASIC22.17■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Gm527-203ENSMUST00000220993 1090 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Preb-209ENSMUST00000202567 1869 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Aspscr1-202ENSMUST00000103016 1689 ntTSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Paqr3-202ENSMUST00000112968 1875 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Mospd3-201ENSMUST00000037620 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC22.15■■□□□ 1.14
9030624G23RikQ9D308 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Stard3nl-201ENSMUST00000039694 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Gng13-201ENSMUST00000115108 347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Msto1-202ENSMUST00000126245 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Bckdhb-206ENSMUST00000190637 1477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Csnk1g2-201ENSMUST00000079773 2348 ntTSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Dnpep-201ENSMUST00000066668 2488 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Tnfsfm13-201ENSMUST00000108649 1049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Syndig1l-201ENSMUST00000095550 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Arf6-201ENSMUST00000050063 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Uba52-205ENSMUST00000129909 705 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
9030624G23RikQ9D308 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Cys1-203ENSMUST00000156453 1732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Tsen34-203ENSMUST00000108629 1238 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Gsx1-201ENSMUST00000065382 1773 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 A330023F24Rik-201ENSMUST00000181226 955 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
9030624G23RikQ9D308 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Tmem235-201ENSMUST00000093905 1820 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Slc22a17-208ENSMUST00000228119 2348 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Amigo1-201ENSMUST00000050909 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Cdkn2b-201ENSMUST00000097981 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 E130102H24Rik-201ENSMUST00000144604 741 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Cops6-202ENSMUST00000110951 1098 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Ppp1r14b-201ENSMUST00000070850 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Ccsap-202ENSMUST00000122421 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Rundc3a-203ENSMUST00000107103 1822 ntTSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Foxa2-202ENSMUST00000109964 2070 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Spg7-201ENSMUST00000108868 845 ntTSL 2 BASIC21.97■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Olfm1-201ENSMUST00000028177 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Cadm1-202ENSMUST00000085909 2126 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.96■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 H2afy-202ENSMUST00000045788 1933 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
9030624G23RikQ9D308 Ccsap-201ENSMUST00000034452 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
9030624G23RikQ9D308 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
9030624G23RikQ9D308 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
9030624G23RikQ9D308 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
9030624G23RikQ9D308 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
9030624G23RikQ9D308 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
9030624G23RikQ9D308 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
9030624G23RikQ9D308 Scx-201ENSMUST00000043089 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
9030624G23RikQ9D308 Cetn4-202ENSMUST00000075537 762 ntTSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
9030624G23RikQ9D308 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.5 ms