Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1F3

Uncharacterized protein CXorf40 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 157 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9D1F3 Galnt12-202ENSMUST00000107744 2077 ntTSL 1 (best) BASIC24.68■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Pkd1-207ENSMUST00000228550 1050 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Raly-201ENSMUST00000029120 1802 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Dlg1-203ENSMUST00000100001 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Mrpl23-201ENSMUST00000038675 692 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Dmwd-201ENSMUST00000032570 2494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Lmo2-202ENSMUST00000111140 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D1F3 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Q9D1F3 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Srarp-201ENSMUST00000094544 905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Rundc3a-204ENSMUST00000107105 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.62■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Gm17494-201ENSMUST00000072769 1800 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Gli3-204ENSMUST00000141194 466 ntTSL 2 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Gm15918-201ENSMUST00000137259 689 ntTSL 3 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Mpped1-208ENSMUST00000163723 1064 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Rab2a-201ENSMUST00000060232 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Q9D1F3 Slc16a6-203ENSMUST00000070872 2354 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Pfdn2-202ENSMUST00000135941 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Traf4-201ENSMUST00000017530 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Gm9905-201ENSMUST00000065740 1845 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Gm43573-201ENSMUST00000196445 570 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Gm5786-201ENSMUST00000085368 882 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Q9D1F3 1700020L24Rik-201ENSMUST00000037378 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Clk2-201ENSMUST00000090927 2128 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Babam2-209ENSMUST00000201352 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Gm20512-201ENSMUST00000172483 618 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Eif4ebp1-201ENSMUST00000033880 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Q9D1F3 Dtnb-211ENSMUST00000173240 2218 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Zfp358-201ENSMUST00000061508 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D1F3 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Klhl15-202ENSMUST00000113908 1235 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Cox4i1-205ENSMUST00000181586 765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Smagp-201ENSMUST00000066068 1132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Grb2-202ENSMUST00000106495 2041 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D1F3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Rnf220-212ENSMUST00000221654 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Trappc6b-201ENSMUST00000021380 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Fam149b-201ENSMUST00000037698 924 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Ap1ar-210ENSMUST00000200409 2580 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D1F3 Rnaset2a-201ENSMUST00000097420 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D1F3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Q9D1F3 AC153366.1-201ENSMUST00000218132 1056 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D1F3 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Q9D1F3 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Q9D1F3 Gm13889-201ENSMUST00000099689 1386 ntBASIC24.43■■□□□ 1.5
Q9D1F3 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D1F3 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D1F3 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D1F3 2510046G10Rik-202ENSMUST00000187458 1052 ntBASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D1F3 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Q9D1F3 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Q9D1F3 E030037K01Rik-201ENSMUST00000180928 1756 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D1F3 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D1F3 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D1F3 Dazap1-201ENSMUST00000092305 1994 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Q9D1F3 Gm7332-201ENSMUST00000118351 454 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Vegfa-211ENSMUST00000167860 975 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Vegfa-213ENSMUST00000217017 1179 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D1F3 4933429H19Rik-202ENSMUST00000187361 995 ntBASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Map2k7-201ENSMUST00000003027 1626 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Siva1-201ENSMUST00000021728 924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Gm45713-201ENSMUST00000209467 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Q9D1F3 Erf-202ENSMUST00000116343 690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.1 ms