Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1C8

Vps28, Vacuolar protein sorting-associated protein 28 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 221 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vps28Q9D1C8 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC24.17■■□□□ 1.46
Vps28Q9D1C8 Ebf4-203ENSMUST00000110288 2982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps28Q9D1C8 Det1-201ENSMUST00000032839 2269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps28Q9D1C8 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps28Q9D1C8 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps28Q9D1C8 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps28Q9D1C8 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps28Q9D1C8 Nelfe-201ENSMUST00000097343 1607 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.16■■□□□ 1.46
Vps28Q9D1C8 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps28Q9D1C8 Zdhhc2-202ENSMUST00000128166 1547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps28Q9D1C8 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps28Q9D1C8 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Vps28Q9D1C8 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC24.13■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 Klhl35-201ENSMUST00000037359 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 Rab40c-209ENSMUST00000179998 2456 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.1■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Vps28Q9D1C8 E2f5-201ENSMUST00000029069 1779 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.08■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Zbtb12-201ENSMUST00000052778 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Rcor2-201ENSMUST00000066646 2801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Vps28Q9D1C8 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Rcan1-202ENSMUST00000060005 2324 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Vps28Q9D1C8 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC23.95■■□□□ 1.42
Vps28Q9D1C8 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC23.94■■□□□ 1.42
Vps28Q9D1C8 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps28Q9D1C8 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps28Q9D1C8 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps28Q9D1C8 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Vps28Q9D1C8 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps28Q9D1C8 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps28Q9D1C8 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC23.91■■□□□ 1.42
Vps28Q9D1C8 Xkr7-201ENSMUST00000037235 2711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Vps28Q9D1C8 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Vps28Q9D1C8 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Vps28Q9D1C8 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps28Q9D1C8 Clptm1l-201ENSMUST00000022102 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Vps28Q9D1C8 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Vps28Q9D1C8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps28Q9D1C8 Uncx-201ENSMUST00000172997 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Vps28Q9D1C8 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps28Q9D1C8 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps28Q9D1C8 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Vps28Q9D1C8 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps28Q9D1C8 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.83■■□□□ 1.41
Vps28Q9D1C8 Ctbp1-211ENSMUST00000202868 2436 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps28Q9D1C8 Pard6a-201ENSMUST00000093195 1265 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps28Q9D1C8 Nek6-202ENSMUST00000112895 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps28Q9D1C8 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.82■■□□□ 1.4
Vps28Q9D1C8 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps28Q9D1C8 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps28Q9D1C8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.81■■□□□ 1.4
Vps28Q9D1C8 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps28Q9D1C8 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.8■■□□□ 1.4
Vps28Q9D1C8 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Vps28Q9D1C8 Zcrb1-201ENSMUST00000076070 877 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.79■■□□□ 1.4
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.6 ms