Protein–RNA interactions for Protein: Q9D198

Syf2, Pre-mRNA-splicing factor SYF2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 242 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syf2Q9D198 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Btf3-201ENSMUST00000022163 1091 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Slc17a7-201ENSMUST00000085374 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Tcte2-204ENSMUST00000130033 1462 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Upf3a-201ENSMUST00000043767 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Yrdc-201ENSMUST00000102628 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Syf2Q9D198 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Ube2i-206ENSMUST00000172618 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Brf1-201ENSMUST00000011302 2615 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
Syf2Q9D198 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Vdac2-201ENSMUST00000022293 1954 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 6530409C15Rik-202ENSMUST00000143551 1573 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Crem-227ENSMUST00000149803 1422 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Jag2-201ENSMUST00000075827 5106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Prr5-201ENSMUST00000065499 1830 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Gm26566-201ENSMUST00000181601 1038 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Sowahd-201ENSMUST00000060057 1574 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Ankrd28-201ENSMUST00000014640 6712 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Kmt5a-202ENSMUST00000100709 1425 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
Syf2Q9D198 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Cabp1-204ENSMUST00000112113 1621 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 5730480H06Rik-201ENSMUST00000030968 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Trp53rkb-202ENSMUST00000065753 1375 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Egr3-201ENSMUST00000035908 1509 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Fam126a-206ENSMUST00000197617 2288 ntTSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 A530058N18Rik-208ENSMUST00000131299 1387 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Kmt5a-201ENSMUST00000059580 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Dcaf15-201ENSMUST00000041367 2312 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Vdac3-202ENSMUST00000179233 1423 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Snx3-201ENSMUST00000019939 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
Syf2Q9D198 Ubac1-201ENSMUST00000036509 1852 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Macrod1-201ENSMUST00000040261 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Tcf15-201ENSMUST00000089112 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
Syf2Q9D198 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.29■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms