Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU9

2610524H06Rik, RIKEN cDNA 2610524H06, mousemouse

Predictions only

Length 139 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
2610524H06RikQ9CZU9 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.87■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Pcgf5-201ENSMUST00000062389 1566 ntTSL 5 BASIC19.86■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.86■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 C1ql1-201ENSMUST00000057849 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC19.86■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Evl-201ENSMUST00000021689 2180 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Fxyd1-205ENSMUST00000205439 535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.85■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC19.85■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.85■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Camsap1-212ENSMUST00000183461 5090 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.84■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 A530058N18Rik-201ENSMUST00000128469 646 ntTSL 2 BASIC19.84■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 A430072P03Rik-201ENSMUST00000161480 1510 ntTSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Basp1-201ENSMUST00000058845 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.84■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 6330403L08Rik-202ENSMUST00000187923 5522 ntBASIC19.83■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.77
2610524H06RikQ9CZU9 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Hrk-201ENSMUST00000054836 5382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 E2f5-202ENSMUST00000165922 1751 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.83■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Rnd2-201ENSMUST00000001347 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.83■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.82■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Grin2d-201ENSMUST00000002848 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Cgref1-201ENSMUST00000031051 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Ip6k1-208ENSMUST00000176854 2251 ntTSL 1 (best) BASIC19.82■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Znrf3-202ENSMUST00000143746 1022 ntTSL 1 (best) BASIC19.81■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Ddx43-201ENSMUST00000113367 2207 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Ppp1r3e-201ENSMUST00000168622 1852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.81■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Arhgap9-203ENSMUST00000219026 1946 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.8■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Tspan33-202ENSMUST00000115250 1977 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Gm15672-201ENSMUST00000151512 1354 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Tsen34-204ENSMUST00000108630 1779 ntTSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.8■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Evl-202ENSMUST00000077735 2121 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Rundc3b-202ENSMUST00000115378 1891 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.79■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Hoxc8-201ENSMUST00000001703 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 E130309D02Rik-201ENSMUST00000046418 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.79■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Micu2-201ENSMUST00000022543 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC19.78■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Cys1-207ENSMUST00000186602 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.78■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Homer3-206ENSMUST00000140212 2608 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Cds2-203ENSMUST00000110158 1247 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Kras-201ENSMUST00000032399 4678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.76
2610524H06RikQ9CZU9 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.77■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.76■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC19.75■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.75■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 H3f3aos-201ENSMUST00000097448 2905 ntBASIC19.75■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Spsb3-205ENSMUST00000120943 1949 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Txnrd1-208ENSMUST00000219962 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Klhl22-201ENSMUST00000117192 2754 ntTSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 A530058N18Rik-207ENSMUST00000152254 1211 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 2810002D19Rik-201ENSMUST00000152313 2040 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 D130020L05Rik-201ENSMUST00000180800 2431 ntTSL 1 (best) BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Fam149b-202ENSMUST00000051915 1981 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.74■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Rmnd5a-201ENSMUST00000002292 6165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Ccnd3-205ENSMUST00000182209 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.73■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Yars2-201ENSMUST00000059955 1574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Hdac1-201ENSMUST00000102597 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.73■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Sap30l-201ENSMUST00000020826 1151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Il17d-201ENSMUST00000089494 1274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Tcf4-246ENSMUST00000202116 2986 ntTSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Sos2-201ENSMUST00000035773 5607 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.72■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.72■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Lmo2-203ENSMUST00000111143 1654 ntTSL 1 (best) BASIC19.71■□□□□ 0.75
2610524H06RikQ9CZU9 Hccs-201ENSMUST00000033717 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.7■□□□□ 0.74
2610524H06RikQ9CZU9 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
2610524H06RikQ9CZU9 Shb-201ENSMUST00000061986 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
2610524H06RikQ9CZU9 Zdhhc2-205ENSMUST00000167766 1759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
2610524H06RikQ9CZU9 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
2610524H06RikQ9CZU9 Foxo6-201ENSMUST00000102656 2615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.69■□□□□ 0.74
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.6 ms