Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZU3

Mtrex, Exosome RNA helicase MTR4, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,040 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MtrexQ9CZU3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Gm12523-201ENSMUST00000148844 599 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.54
MtrexQ9CZU3 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Uba52-207ENSMUST00000140679 697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.63■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Srcap-211ENSMUST00000189136 1960 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Eif5a-201ENSMUST00000043419 1437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Pcsk1n-201ENSMUST00000041096 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Vdac1-202ENSMUST00000102758 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Snx3-203ENSMUST00000105500 753 ntTSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Evx2-202ENSMUST00000173623 1428 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 E2f6-201ENSMUST00000020908 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Gm31266-201ENSMUST00000192060 656 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Slc39a13-201ENSMUST00000073575 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MtrexQ9CZU3 Zfp513-202ENSMUST00000114590 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Gm20402-201ENSMUST00000174738 687 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Maz-204ENSMUST00000206254 2282 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Tmem200b-201ENSMUST00000094666 1370 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Cited2-203ENSMUST00000219558 2411 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Hoxb3os-202ENSMUST00000147410 1945 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Gm9939-201ENSMUST00000067161 1154 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Rnf115-201ENSMUST00000029740 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MtrexQ9CZU3 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Suv39h2-202ENSMUST00000060618 1831 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Crls1-201ENSMUST00000028835 1924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Gskip-202ENSMUST00000222284 1064 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Pradc1-201ENSMUST00000032080 1038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Mpp6-209ENSMUST00000204545 2418 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Ei24-202ENSMUST00000163192 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
MtrexQ9CZU3 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC24.45■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.44■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Hnrnpl-201ENSMUST00000038572 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Glrx2-205ENSMUST00000145571 758 ntTSL 2 BASIC24.43■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Cnnm3-202ENSMUST00000097776 5292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Nans-201ENSMUST00000030018 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Iscu-203ENSMUST00000112312 1116 ntTSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 4931440P22Rik-201ENSMUST00000099076 1786 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Tmem260-208ENSMUST00000226400 2281 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Tirap-205ENSMUST00000176685 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Ccna1-202ENSMUST00000197238 1719 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Peg12-201ENSMUST00000094339 2640 ntAPPRIS P1 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MtrexQ9CZU3 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Tnfsfm13-203ENSMUST00000180587 2235 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Adra1d-201ENSMUST00000103184 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Otud5-205ENSMUST00000115668 2543 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 E2f1-201ENSMUST00000000894 2755 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Pde8b-204ENSMUST00000159608 2370 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Fzd9-201ENSMUST00000062572 2293 ntAPPRIS P1 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Gpr12-201ENSMUST00000036211 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Rnf19b-201ENSMUST00000030584 2414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Gm26536-201ENSMUST00000181072 1196 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Ica1-201ENSMUST00000038403 2075 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Six3-201ENSMUST00000162695 2838 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.35■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Pon2-201ENSMUST00000057792 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.33■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Nhlrc1-201ENSMUST00000052747 2294 ntAPPRIS P1 BASIC24.33■■□□□ 1.49
MtrexQ9CZU3 Gm11529-201ENSMUST00000153012 639 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MtrexQ9CZU3 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MtrexQ9CZU3 D030046N08Rik-201ENSMUST00000162318 1570 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MtrexQ9CZU3 Actr3b-202ENSMUST00000128727 2031 ntTSL 1 (best) BASIC24.32■■□□□ 1.48
MtrexQ9CZU3 AC153890.1-201ENSMUST00000220021 2469 ntBASIC24.32■■□□□ 1.48
MtrexQ9CZU3 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
MtrexQ9CZU3 Efcc1-202ENSMUST00000159570 2293 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.31■■□□□ 1.48
MtrexQ9CZU3 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 53.9 ms