Protein–RNA interactions for Protein: Q9CZN4

Shisa9, Protein shisa-9, mousemouse

Predictions only

Length 424 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Shisa9Q9CZN4 Dtnbp1-202ENSMUST00000110128 1305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Mapk1-203ENSMUST00000115731 1747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 2310014F06Rik-201ENSMUST00000146145 1567 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Map3k10-204ENSMUST00000138243 1621 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Pate2-201ENSMUST00000098906 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Acot5-201ENSMUST00000046422 1518 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 D730045B01Rik-202ENSMUST00000186838 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.54
Shisa9Q9CZN4 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 1700084E18Rik-202ENSMUST00000205624 729 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Mta3-201ENSMUST00000067826 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Wdr34-201ENSMUST00000113711 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Bcl7b-201ENSMUST00000031692 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Tsg101-201ENSMUST00000014546 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Dtnb-203ENSMUST00000164578 2355 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Shf-203ENSMUST00000110531 1557 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Gemin7-202ENSMUST00000117222 1023 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 2410017I17Rik-201ENSMUST00000056774 1509 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Otulin-201ENSMUST00000059662 1491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Maf-201ENSMUST00000069009 3223 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Gpr27-201ENSMUST00000101122 2388 ntAPPRIS P1 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Arhgdia-201ENSMUST00000067936 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Ybx3-201ENSMUST00000032309 1853 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Hspb1-202ENSMUST00000111155 930 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 St6galnac6-204ENSMUST00000095045 2536 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Shisa9Q9CZN4 Tdp2-201ENSMUST00000038039 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 Clk2-202ENSMUST00000121212 2154 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm45580-201ENSMUST00000210430 889 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 Tmpo-205ENSMUST00000105293 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Shisa9Q9CZN4 2410017I17Rik-202ENSMUST00000090537 2053 ntTSL 2 BASIC18.27■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 E130218I03Rik-208ENSMUST00000144222 1729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Ssbp4-205ENSMUST00000210369 1828 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Marveld2-202ENSMUST00000163163 2187 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm15156-201ENSMUST00000148217 417 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm17110-201ENSMUST00000171248 735 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Ubp1-203ENSMUST00000116492 2111 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Ablim1-208ENSMUST00000111544 2231 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Gm13889-202ENSMUST00000148314 1240 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Adgrb1-203ENSMUST00000185682 2744 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Zfp91-201ENSMUST00000038627 5531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Kansl2-201ENSMUST00000023727 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Neurog2-201ENSMUST00000029587 2227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 B3gat1-201ENSMUST00000115269 1665 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Shisa9Q9CZN4 Rgs7-206ENSMUST00000194555 2431 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Chpt1-204ENSMUST00000117579 1043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Smurf1-202ENSMUST00000100461 2725 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Cpsf4-205ENSMUST00000160629 1713 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 3110021N24Rik-201ENSMUST00000178992 1812 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Ryk-201ENSMUST00000035142 2852 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Kcna7-201ENSMUST00000107774 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Ube2j2-205ENSMUST00000105583 1434 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Tm6sf1-201ENSMUST00000041890 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Pex10-201ENSMUST00000103180 1688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Shisa9Q9CZN4 Isoc1-201ENSMUST00000025503 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Ccdc136-206ENSMUST00000145310 1703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Fam220a-206ENSMUST00000196487 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Gm5987-201ENSMUST00000196433 1151 ntBASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 St7-208ENSMUST00000115419 2194 ntTSL 1 (best) BASIC18.12■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Nudt9-201ENSMUST00000031250 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Jmy-202ENSMUST00000220513 1843 ntTSL 1 (best) BASIC18.11■□□□□ 0.49
Shisa9Q9CZN4 Panx2-202ENSMUST00000161372 2314 ntTSL 1 (best) BASIC18.1■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.3 ms